卷 首
序
醫門十勸
病家十戒
凡例
臨證必讀
切脈須知
杜執病困醫之弊

卷 一
六經圖說
分經治病
六經定法
〔附〕少陽經易病說
辨諸證之陰陽
溫病
論陽毒陰毒
鬱論
雜病論
人參敗毒散論
湧吐要法

卷 二
風寒證辨
辨訛一則
陽明經證治大意
〔附〕太陰轉陽明一證
〔附〕少陰轉陽明一證
〔附〕厥陰轉陽明一證
少陽經證治大意
太陰經證治大意
〔附〕龜首種子丸方
〔附〕斬關丸方
足少陰腎經證治大意
〔附〕齒痛方與治驗
厥陰經證治大意
〔附〕傷寒發狂發斑結胸中寒等證
痢門挈綱

卷 三
先天圖
先天圖說
先天要論
水火論
先天水火總論
滋陰降火論
相火龍雷論
咳嗽論
痰論
痰飲
陰虛發熱論
咳嗽吐血論
發熱
哮吼齁喘論
虛勞
癆瘵
反胃證
陽強不倒論
陽痿不振論
縮陽證
〔附〕張真人治狐疝神方
〔附〕孫真人治諸疝痛方

卷 四
後天圖
後天圖說
黃蓍白朮不固表說
後天要論
傷飲食脾胃論
中風論
中暑傷暑論
中濕（附：腳氣四案）
氣虛中滿論
喘脹
氣血兩虛辨
消渴
頭痛
耳證
眼目
口瘡
齒病
鼻病
咽痛喉痺痄腮聲啞

卷 五
吐血論
治吐血精義說
血病
夢遺精滑
汗證（遺精、自汗、盜汗）
心跳論
辨肺癰肺痿論
治蟲論
醫案方論
補藥得宜論
大便不通
小便不通

卷 六
女科要言
調經
經閉
安胎
〔附〕胎前預服良方
催生
產後論
乳病
調經論
傳授靈丹
避瘟諸法
化金疫
扣頸瘟治驗
羊毛掙疔
神鬼箭打
摘附《醒醫六書‧瘟疫論》
斑汗合論
藥煩
停藥（用熨法，其效速）
熱結旁流
大腸膠閉
補瀉兼施
奪氣不語
蓄血發黃
下後身反熱
辨達原飲
寒疫治法
大頭瘟治法
治瘟疫方
衄血
罨熨法
崇正辨訛醫案緒言